Équipe
Gilles Favre – Olivier Sordet

SIGNATHER :

Signalisation cellulaire, oncogenèse et thérapeutiques

Les spécificités

de notre axe de recherche

Notre objectif général est de comprendre les anomalies moléculaires des voies de signalisation des cellules cancéreuses et de traduire les découvertes faites au laboratoire en nouvelles stratégies thérapeutiques. Notre premier thème de recherche porte sur les voies de signalisation impliquant les récepteurs à activité tyrosine kinase (RTK)/RAS/MAPK et les RHOGTPases pour comprendre leur rôle dans le contrôle de la prolifération cellulaire, la survie et la progression tumorale, et concevoir de nouvelles stratégies thérapeutiques. Nous étudions aussi la signalisation et les mécanismes de réparation des cassures double-brin (DSB) de l’ADN générées dans les régions transcrites, et leur rôle dans l’oncogenèse et la résistance aux thérapies ciblées. L’expertise de l’équipe à la fois dans les biotechnologies de pointe basées sur les interactions protéine-protéine-GFP, et dans la signalisation et la réponse aux dommages de l’ADN, contribue directement et indirectement à de nouvelles découvertes biologiques et cliniques ainsi qu’à l’émergence de nouveaux concepts dans l’étude de la résistance aux thérapies ciblées et à la découverte de nouvelles cibles. En collaboration étroite avec les services cliniques, nous menons une recherche translationnelle et clinique dans les cancers du poumon.

Signalisation oncogénique

RTK/RAS/MAPK

RHOGTPases

Cancer du poumon

Recherche translationnelle

Biopsies liquides

Biomarqueurs

Essais cliniques

Thérapies ciblées

Résistance

Biotechnologie

Split GFP

Cassures de l’ADN

Instabilité génomique

Transcription

DES PROJETS
DE RECHERCHE

PRODUCTIONS SCIENTIFIQUES

PUBLICATIONS 2021
Keller, Laura, Claudine Tardy, Laetitia Ligat, Julia Gilhodes, Thomas Filleron, Nicolas Bery, Philippe Rochaix, et al. “Nanobody-Based Quantification of GTP-Bound RHO Conformation Reveals RHOA and RHOC Activation Independent from Their Total Expression in Breast Cancer.” Analytical Chemistry 93, no. 15 (April 20, 2021): 6104–11. https://doi.org/10.1021/acs.analchem.0c05137.
Klionsky, Daniel J., Amal Kamal Abdel-Aziz, Sara Abdelfatah, Mahmoud Abdellatif, Asghar Abdoli, Steffen Abel, Hagai Abeliovich, et al. “Guidelines for the Use and Interpretation of Assays for Monitoring Autophagy (4th Edition)1.” Autophagy 17, no. 1 (January 2021): 1–382. https://doi.org/10.1080/15548627.2020.1797280.
Bery, Nicolas, Gilles Favre, and Aurélien Olichon. “Protocol to Select Conformation-Specific Intracellular Antibodies for Targeted Protein Degradation in an Engineered Cell Line.” STAR Protocols 2, no. 1 (2021): 100249. https://doi.org/10.1016/j.xpro.2020.100249.
Cristini, Agnese, Mathéa Géraud, and Olivier Sordet. “Transcription-Associated DNA Breaks and Cancer: A Matter of DNA Topology.” International Review of Cell and Molecular Biology 364 (2021): 195–240. https://doi.org/10.1016/bs.ircmb.2021.05.001.
PUBLICATIONS 2020
Durin, Lucile, Anne Pradines, Céline Basset, Bryan Ulrich, Laura Keller, Vincent Dongay, Gilles Favre, Julien Mazieres, and Nicolas Guibert. “Liquid Biopsy of Non-Plasma Body Fluids in Non-Small Cell Lung Cancer: Look Closer to the Tumor!” Cells 9, no. 11 (November 16, 2020). https://doi.org/10.3390/cells9112486.
Laplagne, Chloé, Sarah Meddour, Sarah Figarol, Marie Michelas, Olivier Calvayrac, Gilles Favre, Camille Laurent, Jean-Jacques Fournié, Stéphanie Cabantous, and Mary Poupot. “Vγ9Vδ2 T Cells Activation Through Phosphoantigens Can Be Impaired by a RHOB Rerouting in Lung Cancer.” Frontiers in Immunology 11 (July 7, 2020): 1396. https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.01396.
Guibert, Nicolas, Anne Pradines, Gilles Favre, and Julien Mazieres. “Current and Future Applications of Liquid Biopsy in Nonsmall Cell Lung Cancer from Early to Advanced Stages.” European Respiratory Review: An Official Journal of the European Respiratory Society 29, no. 155 (March 31, 2020). https://doi.org/10.1183/16000617.0052-2019.
Cristini, Agnese, Natalia Gromak, and Olivier Sordet. “Transcription-Dependent DNA Double-Strand Breaks and Human Disease.” Molecular & Cellular Oncology 7, no. 2 (March 3, 2020): 1691905. https://doi.org/10.1080/23723556.2019.1691905.
Guibert, Nicolas, Anne Pradines, Gilles Favre, and Julien Mazières. “La Recherche de Mutations Dans l’ADN Tumoral Circulant Aide à Prédire La Réponse à l’immunothérapie Dans Le Cancer Du Poumon.” Médecine/Sciences 36, no. 5 (2020): 437–39. https://doi.org/10.1051/medsci/2020068.
PUBLICATIONS 2019
Bousquet Mur, Emilie, Sara Bernardo, Laura Papon, Maicol Mancini, Eric Fabbrizio, Marion Goussard, Irene Ferrer, et al. “Notch Inhibition Overcomes Resistance to Tyrosine Kinase Inhibitors in EGFR-Driven Lung Adenocarcinoma.” The Journal of Clinical Investigation, October 31, 2019. https://doi.org/10.1172/JCI126896.
Cristini, Agnese, Giulia Ricci, Sébastien Britton, Simona Salimbeni, Shar-Yin Naomi Huang, Jessica Marinello, Patrick Calsou, et al. “Dual Processing of R-Loops and Topoisomerase I Induces Transcription-Dependent DNA Double-Strand Breaks.” Cell Reports 28, no. 12 (September 17, 2019): 3167-3181.e6. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.08.041.
Bery, Nicolas, Laura Keller, Marjorie Soulié, Rémi Gence, Anne-Laure Iscache, Julia Cherier, Stéphanie Cabantous, et al. “A Targeted Protein Degradation Cell-Based Screening for Nanobodies Selective toward the Cellular RHOB GTP-Bound Conformation.” Cell Chemical Biology, September 11, 2019. https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2019.08.009.
Guibert, Nicolas, Greg Jones, John F. Beeler, Vincent Plagnol, Clive Morris, Jean Mourlanette, Myriam Delaunay, et al. “Targeted Sequencing of Plasma Cell-Free DNA to Predict Response to PD1 Inhibitors in Advanced Non-Small Cell Lung Cancer.” Lung Cancer (Amsterdam, Netherlands) 137 (September 6, 2019): 1–6. https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2019.09.005.
Mouly, Laetitia, Julia Gilhodes, Anthony Lemarié, Elizabeth Cohen-Jonathan Moyal, Christine Toulas, Gilles Favre, Olivier Sordet, and Sylvie Monferran. “The RND1 Small GTPase: Main Functions and Emerging Role in Oncogenesis.” International Journal of Molecular Sciences 20, no. 15 (July 24, 2019). https://doi.org/10.3390/ijms20153612.
Tichauer, Ruth H., Gilles Favre, Stéphanie Cabantous, and Marie Brut. “Hybrid QM/MM vs Pure MM Molecular Dynamics for Evaluating Water Distribution within P21N-Ras and the Resulting GTP Electronic Density.” The Journal of Physical Chemistry. B 123, no. 18 (May 9, 2019): 3935–44. https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.9b02660.
Keller, Laura, Nicolas Guibert, Anne Casanova, Stephanie Brayer, Magali Farella, Myriam Delaunay, Julia Gilhodes, et al. “Early Circulating Tumour DNA Variations Predict Tumour Response in Melanoma Patients Treated with Immunotherapy.” Acta Dermato-Venereologica 99, no. 2 (February 1, 2019): 206–10. https://doi.org/10.2340/00015555-3080.
Desjobert, Cécile, Arnaud Carrier, Audrey Delmas, Diego M. Marzese, Antoine Daunay, Florence Busato, Arnaud Pillon, et al. “Demethylation by Low-Dose 5-Aza-2’-Deoxycytidine Impairs 3D Melanoma Invasion Partially through MiR-199a-3p Expression Revealing the Role of This MiR in Melanoma.” Clinical Epigenetics 11, no. 1 (January 16, 2019): 9. https://doi.org/10.1186/s13148-018-0600-2.
De Magis, Alessio, Stefano G. Manzo, Marco Russo, Jessica Marinello, Rita Morigi, Olivier Sordet, and Giovanni Capranico. “DNA Damage and Genome Instability by G-Quadruplex Ligands Are Mediated by R Loops in Human Cancer Cells.” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 116, no. 3 (January 15, 2019): 816–25. https://doi.org/10.1073/pnas.1810409116.
Keller, Laura, Nicolas Bery, Claudine Tardy, Laetitia Ligat, Gilles Favre, Terence H. Rabbitts, and Aurélien Olichon. “Selection and Characterization of a Nanobody Biosensor of GTP-Bound RHO Activities.” Antibodies (Basel, Switzerland) 8, no. 1 (January 9, 2019). https://doi.org/10.3390/antib8010008.
Calvayrac, Olivier, Ada Nowosad, Stéphanie Cabantous, Lin-Po Lin, Sarah Figarol, Pauline Jeannot, Murielle P. Serres, et al. “Cytoplasmic P27Kip1 Promotes Tumorigenesis via Suppression of RhoB Activity.” The Journal of Pathology 247, no. 1 (January 2019): 60–71. https://doi.org/10.1002/path.5167.

LES MEMBRES DE L’ÉQUIPE

Mathéa Géraud
Etudiant ou stagiaire / PhD student and Trainee
Gilles Favre
Enseignant-chercheur / Teacher-researcher
Claire Medale Giamarchi
Ingénieur ou technicien / Engineer and Technician
Laura Keller
Enseignant-chercheur / Teacher-researcher
Isabelle Lajoie-Mazenc
Enseignant-chercheur / Teacher-researcher
Agnese Cristini
Chercheur / Researcher
Sebastian Castillo
Etudiant ou stagiaire / PhD student and Trainee
Lara Fernandez-Martinez
Etudiant ou stagiaire / PhD student and Trainee
Delphine Pagan
Ingénieur ou technicien / Engineer and Technician
Anne Pradines
Chercheur / Researcher
Estelle Clermont
Ingénieur ou technicien / Engineer and Technician
Stephanie Cabantous
Chercheur / Researcher
Olivier Calvayrac
Chercheur / Researcher
Célia Delahaye
Chercheur / Researcher
Sarah Figarol
Ingénieur ou technicien / Engineer and Technician
Patrick Chinestra
Ingénieur ou technicien / Engineer and Technician
Sandra Pagano
Etudiant ou stagiaire / PhD student and Trainee
Olivier Sordet
Chercheur / Researcher
Anne Casanova
Ingénieur ou technicien / Engineer and Technician
Rémi Gence
Ingénieur ou technicien / Engineer and Technician

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