Single-cell spatial explorer est un logiciel qui permet d’analyser les caractéristiques cellulaires en relation avec leur position sur un tissu.

Single-Cell Spatial Explorer permet aux chercheur d’analyser les caractéristiques cellulaires en relation avec leur position sur un tissu. Ce logiciel est capable de superposer des couches d’information sur une image d’un tissu, comme l’expression des gènes, les types cellulaires et jusqu’à 29000 fonctions biologiques. Il s’agit donc d’un outil très puissant pour comprendre des mécanismes pathologiques comme la biologie du cancer par exemple.

Collaborations et remerciements

Ce travail a été soutenu par :

• l’Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM),
• l’Université Toulouse 3-Paul Sabatier (UPS),
• le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) ;
• Laboratoire d’Excellence Toulouse Cancer (TOUCAN-2) sous contrat de subvention ANR11-LABX ;
• la Fondation ARC sous contrat de subvention PGA1-RF2019-0208691 ;
• l’Institut Universitaire du Cancer de Toulouse-Oncopole sous contrat CIEL ;
• l’Institut Carnot Lymphome sous contrat CALYM (collection).