APPAREILS
– gÉNomique

  & TRANSCRIPTOMIQUE

Chromium Single Cell Controller

 

Isolement de cellules uniques pour l’analyse de l’expression des gènes en séquençage NGS (10X Genomics)

Cette technologie permet de séparer de 500 à 10000 cellules/échantillon et d’analyser leur expression génique individuelle. L’approche de l’hétérogénéité cellulaire est rendue possible. Le principe repose sur l’encapsulation d’une cellule dans une gouttelette d’huile qui renferme une bille sur laquelle sont fixés des oligonucléotides poly dT pour capturer les ARNm. L’unicité est donnée par l’utilisation d’un code barre spécifique à chaque bille.

Afin de de mieux identifier les sous-populations ou de suivre l’expression d’une protéine de surface d’intérêt, il est possible de coupler la mesure d’expression génique individuelle à l’identification de protéines de surface cellulaire par la méthode CITE-Seq (marquage par Anticorps).

D’autres applications se développent au fur et à mesure : VDJ, ATAC-Seq (Epigénétique), CNV…

 

 

L’accès à cette technologie se fait par prestation de projet et devis spécifique.

Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse

Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (Oncopole)

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